明代出现了规模较大的制墨作坊，开墨坊、墨店的人增多，出现了墨业歙、休两大派系。嘉靖年间，歙派以罗小华为代表，他制墨用桐油烟并加入"金珠玉屑"等配料，使墨品质精良，"坚如石，纹如犀，黑如漆，一螺值万钱"。罗小华因善制墨而受嘉靖皇帝的赏识。当上了中书舍人。

万历年间，歙派又有程君房、方于鲁两家兴起。程君房独创漆烟制墨法，将精工制成的"百子图"和"百牛图"墨送进宫中，明神宗朱翊钧用此墨写字，由于蘸得太多，落下一滴墨汁在桌上，擦来擦去擦不干净，只好叫宫人用刨子刨，这位皇帝惊奇地脱口而赞："入木三分，超过墨漆！"从此，徽州墨中之上品便称"超漆烟"。程君房自豪地说："我墨百年可化黄金！"后人取意，制"金不换墨"。明代着名书画家董其昌用其墨后，赞道："百年之后，无房君之名而有房君之墨；千年之后，无房君之墨，而有房君之名"。方于鲁原是程君房家中墨工，因失和而自立门户。方于鲁注重制大墨，墨模雕刻很细，在墨出模后再做一次深加工，"磋以锉，摩以木贼，继以脂帚，润以漆，袭以香药"，使墨块的外表，"光可晰人，色不染手，清有余润，研无留迹"。

程、方两家的墨模都请名画家丁云鹏画图，由木刻家黄德茂、黄璘檩镌刻。墨制成后还要描金着色，使徽墨的外形更加美观精雅，成为艺术品。程君房编刊的《程氏墨苑》和方于鲁编刊的《方氏墨谱》，完整地保存了两家各自墨品的图录，共近千种，是研究墨锭形制的重要史料，反映了明代徽派刻版制模的艺术成就，也是明代徽派版画艺术的优秀作品。

休宁派的创始人是汪中山、邵青丘，他们于1622年创制了"集锦墨"，将各种鸟兽或山水花卉刻制成模具。例如，一套"黄山图"十八锭，两面刻有黄山三十六峰，合起来看就是一幅完整的黄山画卷。这种集锦墨装潢非常考究，用漆盒绫罗丝锦盒包装，使集墨者爱不释手。休宁派的吴叔大所制的"仿古墨"，是仿汉魏六朝和唐宋名家的杰作而制成的观赏墨，用"垂以千秋，用光宝石"的赞语，取名"千秋光"。